As few answers already suggested the gnuplot is a great choice.
However, there is no need to call a gnuplot subprocess, it might be much easier to use a python gnuplotlib library.
Example (from: https://github.com/dkogan/gnuplotlib):
>>> import numpy as np
>>> import gnuplotlib as gp
>>> x = np.linspace(-5,5,100)
>>> gp.plot( x, np.sin(x) )
[ graphical plot pops up showing a simple sinusoid ]
>>> gp.plot( (x, np.sin(x), {'with': 'boxes'}),
... (x, np.cos(x), {'legend': 'cosine'}),
... _with="lines",
... terminal="dumb 80,40",
... unset="grid")
[ ascii plot printed on STDOUT]
1 +-+---------+----------+-----------+-----------+----------+---------+-+
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0.8 +-+ |||||| + + ++||||||+ +-+
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0.6 +-+ |||||||| + +||||||||||+ +-+
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0.4 +-+ ||||||||| | ++||||||||||||+ +-+
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0.2 +-+ ||||||||||| + ||||||||||||||||| + +-+
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0 +-+ +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ +-+
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